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雅酶丨磁珠:蛋白互作小幫手

前言

作為科研“達(dá)人”,“蛋白與蛋白的相互作用”這一課題想必大家都很熟悉。研究這一課題的套路很多,這里我們重點(diǎn)聊一聊磁珠在這方面的應(yīng)用。


磁珠的結(jié)構(gòu)


磁珠是一類具有超順磁性的磁納米粒子。所謂超順磁性,是指磁珠在外磁場(chǎng)的作用下具有弱磁性,容易被吸附,撤去磁場(chǎng)后沒(méi)有剩磁,容易被分散。


磁珠的結(jié)構(gòu)一般包含磁性的內(nèi)核(通常為鐵的衍生物)、具有良好生物相容性的外殼 以及 外殼上偶聯(lián)的各種配體(如羧基、氨基等官能團(tuán)或Protein A/G、抗體等生物大分子)。下圖為羧基磁珠示意圖。

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羧基磁珠示意圖


磁珠之所以能在蛋白互作上大顯身手,突出的特點(diǎn)就是蛋白荷載量高,特異性強(qiáng),樣品損失小,操作便捷??傊褪呛?jiǎn)單加方便!


一般的實(shí)驗(yàn)流程如下

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1. 磁珠與樣品共同孵育,捕獲目的蛋白;

2. 加外磁場(chǎng)吸附磁珠,棄掉上清液;

3. 加入漂洗液漂洗,去掉非特異結(jié)合蛋白;

4. 加入洗脫液洗脫,收集目的蛋白。


 如何選擇磁珠


蛋白純化磁珠常用的配體有Protein A、Protein G、Protein A/G、標(biāo)簽蛋白抗體、鏈霉親和素蛋白等。

 

Protein A/G磁珠是在磁珠表面偶聯(lián)Protein A/G,而Protein A/G能與IgG相結(jié)合,因此可以用來(lái)純化各種抗體。Protein A/G磁珠也可以通過(guò)結(jié)合不同的抗體,形成“磁珠-抗體-抗原”復(fù)合物,從而捕獲相應(yīng)的抗原或互作蛋白。

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Protein A/G磁珠工作原理圖


相同工作原理的磁珠還有Protein A磁珠和Protein G磁珠。Protein A和Protein G以及Protein A/G在與不同抗體亞型的結(jié)合能力上有所差別,選擇時(shí)可以參照下表。Protein A/G由于是Protein A和Protein G抗體識(shí)別區(qū)域的重組融合蛋白,因此通常在實(shí)驗(yàn)中表現(xiàn)更佳。

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YJ001

Protein A磁珠

YJ002

Protein G磁珠

YJ003

Protein A/G磁珠


需要注意的是,Protein A能與抗體Fc端特異性結(jié)合,Protein G不僅能與Fc端結(jié)合,還能低親力與Fab端特異性結(jié)合。


所以需要純化抗體Fab端的小伙伴,可以選擇Protein A磁珠特異性去除Fc端,這樣就可以獲得Fab端啦!


另外,我司還提供一種瓊脂糖磁珠,與普通磁珠相比,瓊脂糖磁珠的IgG蛋白荷載量更高,更適合用來(lái)純化大量的IgG。


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YJ101

Protein A瓊脂糖磁珠

YJ102

Protein G瓊脂糖磁珠

YJ103

Protein A/G瓊脂糖磁珠


根據(jù)抗原抗體結(jié)合的特異性,研究者將抗體直接與磁珠偶聯(lián),獲得抗體偶聯(lián)磁珠,如anti-Flag免疫磁珠、anti-Myc免疫磁珠等,可以用來(lái)直接捕獲對(duì)應(yīng)的抗原。


與ProteinA/G磁珠相比,抗體偶聯(lián)磁珠不用考慮抗體種屬以及亞型的選擇,操作上也少了磁珠和抗體結(jié)合的步驟,大大縮短實(shí)驗(yàn)時(shí)間。目前大部分磁珠偶聯(lián)的抗體為通用的標(biāo)簽蛋白抗體,包括Flag、HA、Myc、GST、His等,因此更適合用來(lái)捕獲外源表達(dá)的標(biāo)簽融合蛋白。

image.png

抗體偶聯(lián)磁珠工作原理圖


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YJ005

Anti-HA免疫磁珠

YJ006

Anti-Myc免疫磁珠

YJ007

Anti-Flag免疫磁珠

YJ008

Anti-GST免疫磁珠

YJ009

Anti-His免疫磁珠

YJ010

Anti-GFP免疫磁珠


還有一種常用的磁珠——鏈霉親和素磁珠,是將鏈霉親和素蛋白(SA)偶聯(lián)在磁珠上,依靠鏈霉親和素和生物素(Biotin)的特異性結(jié)合,能捕獲被生物素標(biāo)記的生物大分子,如生物素化蛋白、核酸等。其結(jié)合能力比抗原抗體的特異性結(jié)合更強(qiáng)。

image.png

鏈霉親和素磁珠工作原理圖


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YJ011

鏈霉親和素磁珠


 常見(jiàn)問(wèn)題分析 


01

用Protein A/G磁珠做免疫沉淀試驗(yàn)(IP)時(shí),沒(méi)有捕獲到目的蛋白?

a、檢測(cè)體系中目的蛋白是否有表達(dá);

b、細(xì)胞裂解液需新鮮制備,加入合適的蛋白酶抑制劑;

c、IP抗體的質(zhì)量問(wèn)題。


02

用標(biāo)簽抗體偶聯(lián)磁珠做IP,標(biāo)簽應(yīng)該構(gòu)建在蛋白的N端還是C端?

理論上標(biāo)簽不管連在蛋白的N端還是C端都可以,前提是標(biāo)簽蛋白沒(méi)有被融合蛋白的三維結(jié)構(gòu)包裹起來(lái),以及不影響目的蛋白的生物學(xué)功能。


03

在IP過(guò)程中出現(xiàn)非特異性條帶如何處理?

a、減少磁珠與樣品孵育時(shí)間;

b、增加漂洗次數(shù);

c、減少樣品總蛋白濃度;

d、如果使用的是Protein A/G磁珠,可以先將樣品與Protein A/G磁珠(不加抗體)孵育30min進(jìn)行預(yù)清除,去除樣品中能和磁珠非特異性結(jié)合的雜蛋白。


04

進(jìn)行Protein A/G磁珠和抗體偶聯(lián)磁珠的回收時(shí),需要注意哪些問(wèn)題?

a、非變性洗脫后的磁珠才能進(jìn)行回收,如低pH洗脫;

b、回收的磁珠只適合用來(lái)重復(fù)純化同種抗體或者標(biāo)簽蛋白;

c、回收的磁珠不建議用來(lái)做Co-IP,以免磁珠上殘留的蛋白干擾實(shí)驗(yàn)結(jié)果。


05

Protein A/G磁珠和抗體偶聯(lián)磁珠回收步驟有哪些?

a、非變性洗脫后的磁珠用低pH洗脫液洗脫3-5次;

b、再用PBS洗3-5次;

c、保存在PBS溶液中,短期內(nèi)可以重復(fù)使用。


06

保存磁珠需要注意哪些問(wèn)題?

磁珠嚴(yán)禁凍結(jié),這會(huì)降低磁珠的蛋白結(jié)合能力。磁珠置于常溫,性能影響不大,但需及時(shí)放回4℃。


磁珠及相關(guān)產(chǎn)品目錄


貨號(hào)

名稱

規(guī)格

價(jià)格

YJ001

Protein A磁珠

1mL

748元

YJ002

Protein G磁珠

1mL

748元

YJ003

Protein A/G磁珠

1mL

748元

YJ004

Protein L磁珠

1mL

1128元

YJ005

Anti-HA免疫磁珠

1mL

1838元

YJ006

Anti-Myc免疫磁珠

1mL

1838元

YJ007

Anti-Flag免疫磁珠

1mL

1838元

YJ008

Anti-GST免疫磁珠

1mL

1838元

YJ009

Anti-His免疫磁珠

1mL

1838元

YJ010

Anti-GFP免疫磁珠

1mL

1838元

YJ011

鏈霉親和素磁珠

1mL

1128元

YJ012

伴刀豆球蛋白 A(ConA)磁珠

1mL

748元

YJ101

Protein A瓊脂糖磁珠

1mL×2

1138元

YJ102

Protein G瓊脂糖磁珠

1mL×2

1138元

YJ103

Protein A/G瓊脂糖磁珠

1mL×2

1138元

YJ104

His標(biāo)簽蛋白純化瓊脂糖凝膠

1mL×10

568元

YJ105

GST標(biāo)簽蛋白純化瓊脂糖凝膠

1mL×10

848元

YJ106

His標(biāo)簽蛋白純化瓊脂糖磁珠

1mL×5

918元

YJ107

GST標(biāo)簽蛋白純化瓊脂糖磁珠

1mL×5

918元

YJ108

Anti-Flag免疫凝膠

1mL

1838元

YJ201

經(jīng)典Protein A/G免疫(共)沉淀試劑盒

≥40次

1198元

YJ202

基礎(chǔ)免疫(共)沉淀試劑盒(無(wú)磁珠)

≥40次

598元

YJ203

經(jīng)典Protein A免疫(共)沉淀試劑盒

≥40次

1198元

YJ204

經(jīng)典Protein G免疫(共)沉淀試劑盒

≥40次

1198元

YJ205

HA免疫(共)沉淀試劑盒

≥40次

2198元

YJ206

Myc免疫(共)沉淀試劑盒

≥40次

2198元

YJ207

Flag免疫(共)沉淀試劑盒

≥40次

2198元

YJ208

Flag免疫(共)沉淀試劑盒(凝膠)

≥40次

2198元

YJ209

GST免疫(共)沉淀試劑盒

≥40次

2198元

YJ210

His免疫(共)沉淀試劑盒

≥40次

2198元

YJ211

GFP免疫(共)沉淀試劑盒

≥40次

2198元


雅酶.jpg

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